First time identification of Pandoraea sputorum from a patient with cystic fibrosis in Argentina: a case report

Background: Pandoraea species are considered emerging pathogens in the context of cystic fibrosis (CF) and are difficult to identify by conventional biochemical methods. These multidrug resistant bacteria remain poorly understood particularly in terms of natural resistance, mechanisms of acquired resistance and impact on the prognosis of the disease and the lung function. Among them, Pandoraea sputorum has been previously described in few cases of CF patients from Spain, Australia, France and United States, underlining the need of more clinical data for a better knowledge of its pathogenicity. This is the first report relating to P. sputorum in a CF patient in Argentina. Case presentation: Pandoraea sputorum was identified in a nine-year-old cystic fibrosis patient from Argentina, after treatment failure during an exacerbation. The isolates were successfully identified by combining molecular techniques based on 16S rRNA sequencing and mass spectrometry (MS) methods, after reassessing previous misidentified isolates by conventional methods. After first isolation of P. sputorum, patient´s clinical condition worsened but later improved after a change in the treatment. Although isolates showed susceptibility to trimethoprim-sulfamethoxazole and imipenem, in our case, the antibiotic treatment failed in the eradication of P. sputorum. Conclusions: All combined data showed a chronic colonization with P. sputorum associated to a deterioration of lung function. We noted that the presence of P. sputorum can be underestimated in CF patients and MALDI-TOF MS appears to be a promising means of accurate identification of Pandoraea species.Fil: Martina, Pablo F.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaFil: Martínez, Mónica Elisabeth. Provincia de Misiones. Ministerio de Salud de la Provincia de Misiones. Hospital público provincial de pediatría de autogestión Dr. Fernando Barreyro; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; ArgentinaFil: Frada, Guillermo. Provincia de Misiones. Ministerio de Salud de la Provincia de Misiones. Hospital público provincial de pediatría de autogestión Dr. Fernando Barreyro; ArgentinaFil: Alvarez, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Leguizamon, Lorena Beatriz. Provincia de Misiones. Ministerio de Salud de la Provincia de Misiones. Hospital público provincial de pediatría de autogestión Dr. Fernando Barreyro; ArgentinaFil: Prieto, Claudia Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Barrias, Carolina. Provincia de Misiones. Ministerio de Salud de la Provincia de Misiones. Hospital público provincial de pediatría de autogestión Dr. Fernando Barreyro; ArgentinaFil: Bettiol, Marisa. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Salud. Hospital de Niños ; ArgentinaFil: Lagares, Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Bosch, María Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Ferreras, Julian Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaFil: Von Specht, Martha Helena. Provincia de Misiones. Ministerio de Salud de la Provincia de Misiones. Hospital público provincial de pediatría de autogestión Dr. Fernando Barreyro; Argentin

Development and evaluation of an in-house database for quick identification of Burkholderia contaminans by MALDI-TOF MS

La espectrometría de masas (EM) (matrix assisted laser desorption ionization-time of flight) MALDI-TOF demostró ser una herramienta robusta para la identificación de numerosos grupos taxonómicos. No obstante, presenta limitaciones. Una ventaja clave de la técnica es la flexibilidad para la incorporación de espectros proteicos de microorganismos ausentes en la base de datos comercial. Dada la prevalencia de Burkholderia contaminans en los pacientes fibroquísticos en Argentina, y a que en ellos es crucial el diagnóstico microbiológico rápido y confiable, la EM MALDI-TOF surge como una herramienta estratégica. El objetivo del trabajo fue desarrollar una base de datos adicional con espectros peptídicos de aislamientos de referencia de B. contaminans. La misma demostró ser exitosa para la identificación del 97% de los aislamientos analizados. Por lo cual la EM MALDI-TOF con la base de datos extendida resultó ser una herramienta útil para la identificación y diferenciación de otras especies relacionadas a B. contaminans.MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption ionization-time of flight) mass spectrometry (MS) proved to be a robust tool for the identification of numerous taxonomic groups. However, it has limitations. A key advantage of this technique is the flexibility for the incorporation of protein profiles of microorganisms not included in the commercial database. Due to the prevalence of Burkholderia contaminans in fibrocystic patients in Argentina and the fact that rapid and reliable microbiological diagnosis is crucial in them, MALDI-TOF MS emerges as a strategic tool. The aim of this work was to develop an additional database with peptide spectra of reference isolates of B. contaminans. This database demonstrated to be successful for the identification of 97% of the isolates analyzed. Therefore, MALDI-TOF MS with the extended database was a useful tool for the identification and differentiation of other related species to B. contaminans.Fil: Cipolla, Lucía. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; ArgentinaFil: Rocca, Florencia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Armitano, Rita Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; ArgentinaFil: Martinez, Claudia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; ArgentinaFil: Almuzara, Marisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Faccone, Diego Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; ArgentinaFil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Prieto, Monica. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud “Dr. C. G. Malbrán”; Argentin

Peptidome profiling for the immunological stratification in sepsis: a proof of concept study

Sepsis has been called the graveyard of pharmaceutical companies due to the numerous failed clinical trials. The lack of tools to monitor the immunological status in sepsis constrains the development of therapies. Here, we evaluated a test based on whole plasma peptidome acquired by MALDI-TOF-mass spectrometer and machine-learning algorithms to discriminate two lipopolysaccharide-(LPS) induced murine models emulating the pro- and anti-inflammatory/immunosuppression environments that can be found during sepsis. The LPS group was inoculated with a single high dose of LPS and the IS group was subjected to increasing doses of LPS, to induce proinflammatory and anti-inflammatory/immunosuppression profiles respectively. The LPS group showed leukopenia and higher levels of cytokines and tissue damage markers, and the IS group showed neutrophilia, lymphopenia and decreased humoral response. Principal component analysis of the plasma peptidomes formed discrete clusters that mostly coincided with the experimental groups. In addition, machine-learning algorithms discriminated the different experimental groups with a sensitivity of 95.7% and specificity of 90.9%. Data reveal the potential of plasma fingerprints analysis by MALDI-TOF-mass spectrometry as a simple, speedy and readily transferrable method for sepsis patient stratification that would contribute to therapeutic decision-making based on their immunological status.Fil: Ledesma, Martin Manuel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Todero, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Maceira, Lautaro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Prieto, Monica. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina. Administración Nacional de Laboratorio e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Epidemiologia. Departamento de Investigación; ArgentinaFil: Vay, Carlos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; ArgentinaFil: Galas, Marcelo Fabián. Organización Panamericana de la Salud; Estados UnidosFil: López, Beatriz. Administración Nacional de Laboratorio e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Epidemiologia. Departamento de Investigación; ArgentinaFil: Yokobori, Noemí. Administración Nacional de Laboratorio e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Epidemiologia. Departamento de Investigación; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rearte, María Bárbara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentin

Structural conformation and self‐assembly process of p31‐43 gliadin peptide in aqueous solution. Implications for celiac disease

Celiac Disease (CeD) is a highly prevalent chronic immune-mediated enteropathy developed in genetically predisposed individuals after ingestion of a group of wheat proteins (called gliadins and glutenins). The 13mer α-gliadin peptide, p31-43, induces proinflammatory responses, observed by in vitro assays and animal models, that may contribute to innate immune mechanisms of CeD pathogenesis. Since a cellular receptor for p31-43 has not been identified, this raises the question of whether this peptide could mediate different biological effects. In this work, we aimed to characterize the p31-43 secondary structure by different biophysical and in silico techniques. By Dynamic Light Scattering (DLS) and using an oligomer/fibril-sensitive fluorescent probe, we showed the presence of oligomers of this peptide in solution. Furthermore, Atomic Force Microscopy (AFM) analysis showed p31-43 oligomers with different height distribution. Also, peptide concentration had a very strong influence on peptide self-organization process. Oligomers gradually increased their size at lower concentration. Whereas, at higher ones, oligomers increased their complexity, forming branched structures. By Circular Dichroism, we observed that p31-43 self-organized in a poly-proline II conformation in equilibrium with βsheets-like structures, whose pH remained stable in the range of 3 to 8. In addition, these findings were supported by Molecular Dynamics Simulation. The formation of p31-43 nanostructures with increased β-sheet structure may help to explain the molecular etiopathogenesis in the induction of pro-inflammatory effects and subsequent damage at the intestinal mucosa in CeD.Fil: Herrera, Maria Georgina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas "Prof. Alejandro C. Paladini". Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Química y Físico-Química Biológicas; ArgentinaFil: Gomez Castro, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Estudios Inmunológicos y Fisiopatológicos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Estudios Inmunológicos y Fisiopatológicos; ArgentinaFil: Prieto, Eduardo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Barrera Guisasola, Exequiel Ernesto. Instituto Pasteur de Montevideo; Uruguay. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Dodero, Veronica Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universitat Bielefeld; AlemaniaFil: Pantano Gutierrez, Sergio Fabian. Instituto Pasteur de Montevideo; UruguayFil: Chirdo, Fernando Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Estudios Inmunológicos y Fisiopatológicos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Estudios Inmunológicos y Fisiopatológicos; Argentin

From drugs to targets: Reverse engineering the virtual screening process on a proteomic scale

Phenotypic screening is a powerful technique that allowed the discovery of antimicrobials to fight infectious diseases considered deadly less than a century ago. In high throughput phenotypic screening assays, thousands of compounds are tested for their capacity to inhibit microbial growth in-vitro. After an active compound is found, identifying the molecular target is the next step. Knowing the specific target is key for understanding its mechanism of action, and essential for future drug development. Moreover, this knowledge allows drug developers to design new generations of drugs with increased efficacy and reduced side effects. However, target identification for a known active compound is usually a very difficult task. In the present work, we present a powerful reverse virtual screening strategy, that can help researchers working in the drug discovery field, to predict a set of putative targets for a compound known to exhibit antimicrobial effects. The strategy combines chemical similarity methods, with target prioritization based on essentiality data, and molecular-docking. These steps can be tailored according to the researchers? needs and pathogen?s available information. Our results show that using only the chemical similarity approach, this method is capable of retrieving potential targets for half of tested compounds. The results show that even for a low chemical similarity threshold whenever domains are retrieved, the correct domain is among those retrieved in more than 80% of the queries. Prioritizing targets by an essentiality criteria allows us to further reduce, up to 3?4 times, the number of putative targets. Lastly, docking is able to identify the correct domain ranked in the top two in about two thirds of cases. Bias docking improves predictive capacity only slightly in this scenario. We expect to integrate the presented strategy in the context of Target Pathogen database to make it available for the wide community of researchers working in antimicrobials discovery.Fil: Schottlender, Gustavo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; ArgentinaFil: Prieto, Juan Manuel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Palumbo, Miranda Clara. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Calculo. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Calculo; ArgentinaFil: Castello, Florencia Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Calculo. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Calculo; ArgentinaFil: Serral, Federico. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Calculo. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Calculo; ArgentinaFil: Sosa, Ezequiel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Turjanskiri, Adrián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Marti, Marcelo Adrian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: Fernández Do Porto, Darío Augusto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Calculo. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Calculo; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentin

Línea 148 accesible: atención inclusiva a la ciudadanía

La línea 148 Accesible, del Centro de Atención Telefónica (CAIT) Línea 148 del Gobierno de la Provincia de Buenos Aires, se puso en funcionamiento a mediados del 2020 para recibir consultas sobre coronavirus y reportar síntomas de COVID-19 de las personas sordas e hipoacúsicas. Esta experiencia inicial sirvió para aprender acerca de las necesidades y modalidades propias en la comunicación con las personas con este tipo de discapacidad. Este artículo plantea la evolución de la iniciativa hacia un contexto más accesible y ampliando el alcance tanto de la participación de las distintas modalidades dentro de esta capacidad, como a la diversidad de trámites sobre los que dar asistencia. Mediante un enfoque integrado, se propone el trabajo en conjunto con quienes habitualmente operan telefónicamente en la línea y los intérpretes de lengua de señas y el personal sordo asignado a esta tarea.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativ

First time identification of <i>Pandoraea sputorum</i> from a patient with cystic fibrosis in Argentina: A case report

Background: Pandoraea species are considered emerging pathogens in the context of cystic fibrosis (CF) and are difficult to identify by conventional biochemical methods. These multidrug resistant bacteria remain poorly understood particularly in terms of natural resistance, mechanisms of acquired resistance and impact on the prognosis of the disease and the lung function. Among them, Pandoraea sputorum has been previously described in few cases of CF patients from Spain, Australia, France and United States, underlining the need of more clinical data for a better knowledge of its pathogenicity. This is the first report relating to P. sputorum in a CF patient in Argentina. Case presentation: Pandoraea sputorum was identified in a nine-year-old cystic fibrosis patient from Argentina, after treatment failure during an exacerbation. The isolates were successfully identified by combining molecular techniques based on 16S rRNA sequencing and mass spectrometry (MS) methods, after reassessing previous misidentified isolates by conventional methods. After first isolation of P. sputorum, patient's clinical condition worsened but later improved after a change in the treatment. Although isolates showed susceptibility to trimethoprim-sulfamethoxazole and imipenem, in our case, the antibiotic treatment failed in the eradication of P. sputorum. Conclusions: All combined data showed a chronic colonization with P. sputorum associated to a deterioration of lung function. We noted that the presence of P. sputorum can be underestimated in CF patients and MALDI-TOF MS appears to be a promising means of accurate identification of Pandoraea species.Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones IndustrialesInstituto de Biotecnologia y Biologia MolecularFacultad de Ciencias Exacta

Archeopalynology: a review of pollen analysis in caves, shelters and open contexts occupied by huntergatherer societies of Argentina (32º–52º s)

La palinología de sitios arqueológicos o arqueopalinología ha sido frecuentemente utilizada en la Argentina tanto para reconstruir la vegetación y los ambientes desde el final del Pleistoceno Tardío hasta tiempos recientes, como para inferir ciertas actividades culturales desarrolladas dentro de los sitios arqueológicos. En el presente trabajo se realizó una revisión de los análisis polínicos realizados a partir de depósitos sedimentarios en sitios arqueológicos en cuevas, aleros y en contextos abiertos correspondientes a sociedades de cazadores-recolectores de la Argentina (32º–52º S), independientemente del periodo cronológico o cultural. Se explican las metodologías aplicadas y los resultados obtenidos y se discuten las limitaciones del análisis polínico; las diferentes formas en que los datos de polen son útiles en este tipo de sitios arqueológicos, y los procesos tafonómicos tales como dispersión, depositación y preservación polínica en estos ambientes depositacionales. La potencialidad y aplicación del análisis polínico en arqueología de sitios cazadores-recolectores se ejemplificó con trabajos representativos en la región pampeana y patagónica, donde se han realizado la mayoría de los estudios arqueopalinológicos. Estos estudios, aunque complejos, ofrecen oportunidades únicas para comprender los entornos y las actividades humanas del pasado.Archeopalynology has been frequently used in Argentina to reconstruct vegetation and environments since the end of Late Pleistocene to the present, and to infer different cultural activities developed into the archaeological sites. The present paper presents a review of pollen analysis of sedimentary sequences from archaeological sites located in caves, shelters and open contexts occupied by hunter-gatherer societies of Argentina (32º–52º S), regardless the chronological or cultural period. The methodologies applied and results obtained are explained and the following topics are discussed the limitations of the pollen analysis; the different ways in which pollen data are useful in this type of archaeological sites; and the taphonomic processes such as pollen dispersal, deposition and preservation in these depositational environments. The potentiality and application of pollen analysis in archaeology of hunter-gatherer sites were exemplified by representative works in the Pampa and Patagonia regions, where most of the archeopalynology studies have been carried out. These studies, often complex, offer unique opportunities to understand the environments and human activities of the past.Fil: Prieto, Aldo Raul. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; ArgentinaFil: Mancini, Maria Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; ArgentinaFil: de Porras, Maria Eugenia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Nivología, Glaciología y Ciencias Ambientales; ArgentinaFil: Bamonte, Florencia Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; ArgentinaFil: Marcos, Maria Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentin

A combined approach of MALDI-TOF mass spectrometry and multivariate analysis as a potential tool for the detection of SARS-CoV-2 virus in nasopharyngeal swabs

Coronavirus disease 2019, known as COVID-19, is caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). The early, sensitive and specific detection of SARS-CoV-2 virus is widely recognized as the critical point in responding to the ongoing outbreak. Currently, the diagnosis is based on molecular real time RT-PCR techniques, although their implementation is being threatened due to the extraordinary demand for supplies worldwide. That is why the development of alternative and / or complementary tests becomes so relevant. Here, we exploit the potential of mass spectrometry technology combined with machine learning algorithms, for the detection of COVID-19 positive and negative protein profiles directly from nasopharyngeal swabs samples. According to the preliminary results obtained, accuracy =67.66 %, sensitivity =61.76 %, specificity =71.72 %, and although these parameters still need to be improved to be used as a screening technique, mass spectrometry- based methods coupled with multivariate analysis showed that it is an interesting tool that deserves to be explored as a complementary diagnostic approach due to the low cost and fast performance. However, further steps, such as the analysis of a large number of samples, should be taken in consideration to determine the applicability of the method developed.Fil: Rocca, María Florencia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Humanidades Ciencias Sociales y de la Salud. Instituto de Estudios e Investigaciones en Enfermería; Argentina. Red Nacional de Espectrometría de Masas Aplicada a la Microbiología Clínica; ArgentinaFil: Zintgraff, Jonathan Cristian. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Humanidades Ciencias Sociales y de la Salud. Instituto de Estudios e Investigaciones en Enfermería; Argentina. Red Nacional de Espectrometría de Masas Aplicada a la Microbiología Clínica; ArgentinaFil: Dattero, María Elena. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Humanidades Ciencias Sociales y de la Salud. Instituto de Estudios e Investigaciones en Enfermería; Argentina. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Medicina Tropical; ArgentinaFil: Santos, Leonardo Silva. Universidad de Talca; ChileFil: Ledesma, Martin Manuel. Red Nacional de Espectrometría de Masas Aplicada A la Microbiología Clínica (renaem Argentina); Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Vay, Carlos Alberto. Red Nacional de Espectrometría de Masas Aplicada a la Microbiología Clínica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Prieto, Mónica Raquel. Red Nacional de Espectrometría de Masas Aplicada a la Microbiología Clínica; Argentina. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Benedetti, Estefanía. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Humanidades Ciencias Sociales y de la Salud. Instituto de Estudios e Investigaciones en Enfermería; Argentina. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Medicina Tropical; ArgentinaFil: Avaro, Martín. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Humanidades Ciencias Sociales y de la Salud. Instituto de Estudios e Investigaciones en Enfermería; Argentina. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Medicina Tropical; ArgentinaFil: Russo, Mara Laura. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Humanidades Ciencias Sociales y de la Salud. Instituto de Estudios e Investigaciones en Enfermería; Argentina. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Medicina Tropical; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Nachtigall, Fabiane Manke. Universidad Autónoma de Chile; ChileFil: Baumeister, Elsa. Universidad Nacional de Santiago del Estero. Facultad de Humanidades Ciencias Sociales y de la Salud. Instituto de Estudios e Investigaciones en Enfermería; Argentina. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud "Dr. Carlos G. Malbrán". Instituto Nacional de Medicina Tropical; Argentin